1959年“庐山会议”后，中央军委又召开了一次扩大，说是军委会议，其实就是彭老总的“批判会”。
林彪主持了本次“批判会”，陈云、叶剑英等中央领导同志受邀参加了本次会议。
向来随和慈祥的陈云，在本次大会上始终板着一张脸，后来林彪回忆起本次会议，感慨地说道：“我和陈云对视了一眼，他的眼神十分冷峻……”
其实陈云和彭德怀并没有太多私交，他一再坚持为老同志平反，只是出于对真理的追求和对正义的坚持！
彭德怀在“庐山会议”提交那份报告的时候，陈云就敏锐地察觉到了危险。
当时，中央普遍都对农村发展持乐观态度，彭德怀在报告中一针见血地批评了当下农村存在的“高指标”、“浮夸风”等不良现象，被很多人认为是“夸大”。
柯庆施趁机打压彭德怀，污蔑彭德怀是想要破坏集体经济，是“反对”毛主席，彭德怀瞬间沦为众矢之的，遭到猛烈围攻。
“庐山会议”后，彭德怀被免除了军职，搬出了中南海，处境十分艰难。
陈云看着这一切深感痛心，他很清楚彭德怀的为人，明白彭德怀是一心为了民生考虑，虽然言辞激烈了一些，但也不至于被免除职位。
陈云想要为彭德怀发声，又担心自己也受到牵连，到时候连一个给彭德怀平反的人都没有了。
彭德怀搬出中南海后，曾经的老战友、老部下几乎和他断了联系，唯独朱德还会时不时地找他聊天、下棋，安慰失落中的彭德怀。
陈云和叶帅也会趁着闲暇时间去吴家花园看望彭德怀，劝说彭德怀耐心等待，将来中央一定会还他一份公道。
“庐山会议”后没多久，中央又召开了一次“批判会”，林彪作为主持人，在会议上大肆批判了彭德怀，与会人士也纷纷跟着林彪的节奏，说了很多不利于彭德怀的话。
陈云也参加了本次会议，他就坐在林彪对面的位置上，全程冷着一张脸，一句话都没有说。
林彪曾点名让陈云发言，却遭到了陈云的忽视，据林彪回忆，当时陈云用十分冷峻的眼光看着他，令人后背生寒。
之后的几年时间中，毛主席也渐渐发现农村基层存在的一些问题，并主动纠正“浮夸风”的错误，主席私下里对彭德怀说道：“也许真理站在你那边，我们都错了。”
陈云作为经济部门的负责人，在毛主席的命令下，率领有关部门抑制全国存在的“浮夸风”现象，自上而下地纠正了一些客观错误，从实际行动上肯定当年彭德怀报告中提出的一些问题。
可惜，陈云的这些举措没能彻底根除“左”的错误倾向，就连他自己，也受到动荡的冲击，一直到1972年，才得以重回中央。
1977年，邓小平历经“三起三落”后成功复出，陈云积极配合邓公，为那些遭到错误对待的老同志、老干部平反，这其中就包括彭德怀。
1978年，中央为彭德怀正式平反，恢复了名誉，可惜彭德怀未能亲眼看到这一天。
